(一)认缴注册弊端

1、责任制不健全。

有限责任公司以其注册资本对公司承担有限责任。现在它认缴了资本，经营不好，就拍拍屁股走人。承担责任就成了一句空话，对公司非常不利。

2.空壳、骗子公司增多。

注册流程简化后，注册公司的人会更多，会出现龙蛇混杂的情况。以前诈骗公司可能会弄个假牌照骗人，聪明人查查资料就不会上当了。现在作弊者注册为真实公司，识别作弊者的难度大大增加。

(二)实缴注册弊端

1.实收制占用了企业的资金，降低了企业资金的运行效率。现实中因为这个制度的约束，无形中抽走了大量资金，由一家代理公司进行虚假注册。虽然公司注册金额表面上比较充足，但公司本身往往没有相应的资产。一旦发生纠纷，由于举证能力的限制，无法保护债权。

2.由于工商行政管理机关监管不力等因素，此时注册资本实缴制度不仅变得空洞，而且无形中成为股东逃避责任的手段。因此，这种制度的建立不仅在一定程度上抑制了投资创业的激情，也不适应市场经济的发展。就这样，国务院出台了公司注册资本登记制度改革。