一般纳税人代理记账和小规模纳税人代理记账最大的区别在于应税销售额，也就是业务量。
具体区别如下：
1、会计凭证不一样。
会计的原因是业务的产生，会计的依据是业务发生后的单据。一般纳税人的应税销售额比较高，所以一般纳税人在数量和金额上比小规模纳税人需要处理更多的单据。此外，一般纳税人涉及增值税的认证和抵扣，操作复杂，涉税事项比小规模纳税人多。
2、报税数量不一样。
小规模纳税人按季度报税，普通纳税人按月报税。
3、会计准则不一样。
一般纳税人每个月都有银行对账单、工资明细表、各种会计凭证来设置明细核算，核算标准高于小规模纳税人。
4、记账审核难度不同。
一般纳税人的增值税有进项票抵扣项，税务局对公司购买假发票抵扣的行为审查非常严格。所以一般纳税人的审核会比小规模纳税人更严格，审核过程会更复杂。
                                       
一般纳税人的记账流程：
1、签合同。接受委托签订金融外包代理记账合同，确定服务项目和费用。
2、收票。届时客户会将当月的会计票据送到记账机构，或者由记账机构安排现场会计到客户指定的地点领取当月的会计票据，并初步整理票据。对于新成立的从未做过财务会计工作的客户，记账公司会帮助他们：开立会计账户，建立会计制度；根据客户提供的合法原始凭证(包括购销发票、入库单、领料单、汇划单、其他财务收支单据、相关经济合同等)编制会计分录。);记账和结账；准备会计报表。
3、做账。会计会计师进一步整理客户账单，及时与客户沟通账单中存在的问题，进行会计核算、账务处理和税务计算。
审计会计人员对记账会计的会计结果进行审计，包括票据的完整性和合法性、会计处理的正确性、计税的合法性、经常项目的检查，准确评估客户会计问题的隐患。在核实所有账目无误后，填写纳税申报表和纳税申报表，并与客户沟通纳税事宜。客户核算、税务登记、减免税手续、一般纳税人申请手续、发票审批手续等。
4、报税。现场会计将审计会计填写的纳税申报表提交给客户开户银行，并进行转税。现场会计师去国家和地方税务局进行国内申报。专人负责网上报税和个人所得税重点纳税人的申报。
　　5、回访。代理公司报税单，财务报表，报税单，与出纳对账，安排下个月的工作。及时向客户反馈最新的税收政策和通知。一般纳税人是指年增值税销售额(以下简称年应税销售额，包括一个公历年度的全部应税销售额)超过财政部规定的小规模纳税人标准的企业和企业。一般纳税人的特点是增值税进项税额可以从销项税额中扣除。