主管地方税务机关对应核定应纳税所得额的情况，要全面正确计算股权转让价格和股权计税成本，应考虑以下因素：一是“资本公积”、“未分配利润”、“盈余公积”累计结余情况，对于应分配未分配的所有者权益应考虑其对价格的影响；

二是债权债务清偿情况，如：应收账款、应付账款、长期借款和长期投资等；

三是资产、存货的增值和减值等情况；

四是股权计税成本的真实性。

按照税收政策，根据企业财务状况对其股权转让价格进行纳税调整，该调增的调增，该调减的调减，填制股权转让纳税调整表，经主管领导审批后，调整纳税行为。股权转让纳税调整表由各市局自定。

对申报的计税依据明显偏低（如平价和低价转让等）且无正当理由的，主管税务机关可参照每股净资产或个人股东享有的股权比例所对应的净资产份额核定。

个人的股权转让涉及到印花税和个人所得税。按照《中华人民共和国印花税暂行条例》及其实施细则的规定，股权转让的按照转让价的万分之五计算缴纳印花税。